Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX54Q8TDD1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms