Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTLL11Q8NHH1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms