Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CSNK2A3Q8NEV1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms