Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BHLHE23Q8NDY6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms