Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CARMIL3Q8ND23 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms