Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HJURPQ8NCD3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HJURPQ8NCD3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms