Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ANKRD53Q8N9V6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms