Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC50Q8IVM0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms