Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms