Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGPD4Q7Z3J3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms