Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TCF23Q7RTU1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TCF23Q7RTU1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms