Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FAM43BQ6ZT52 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FAM43BQ6ZT52 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms