Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLCO4C1Q6ZQN7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms