Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms