Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NANOGP8Q6NSW7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms