Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLX4IPQ5VYV7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms