Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM46CQ5VWP2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FAM46CQ5VWP2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms