Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CEP170Q5SW79 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms