Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP188Q5SRE5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms