Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms