Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC27A3Q5K4L6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC27A3Q5K4L6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms