Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CAVIN4Q5BKX8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CAVIN4Q5BKX8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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