Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SFT2D3Q587I9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SFT2D3Q587I9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms