Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KLHL12Q53G59 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms