Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACSM3Q53FZ2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACSM3Q53FZ2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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