Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ANKRD55Q3KP44 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD55Q3KP44 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ANKRD55Q3KP44 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms