Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF4Q2M2E3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF4Q2M2E3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms