Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UPP1Q16831 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms