Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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LAMA4Q16363 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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LAMA4Q16363 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LAMA4Q16363 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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