Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS72Q15906 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms