Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFNB3Q15768 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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EFNB3Q15768 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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EFNB3Q15768 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFNB3Q15768 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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