Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TAF11Q15544 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms