Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RABEP1Q15276 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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RABEP1Q15276 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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