Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms