Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NCAPHQ15003 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCAPHQ15003 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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