Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CLCA4Q14CN2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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CLCA4Q14CN2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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