Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
COL19A1Q14993 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms