Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRIM25Q14258 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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