Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK13Q14004 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK13Q14004 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
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