Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
APOFQ13790 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
APOFQ13790 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOFQ13790 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOFQ13790 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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