Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CUL4BQ13620 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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