Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL3Q13618 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL3Q13618 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL3Q13618 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL3Q13618 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL3Q13618 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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CUL3Q13618 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CUL3Q13618 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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