Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF5Q13568 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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IRF5Q13568 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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IRF5Q13568 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IRF5Q13568 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
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