Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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NAE1Q13564 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NAE1Q13564 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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