Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN4PQ13434 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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MKRN4PQ13434 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MKRN4PQ13434 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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