Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SKP2Q13309 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms