Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIGQ13278 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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