Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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