Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSTF3Q12996 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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