Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HSPB3Q12988 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
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